Descripción
Aprenda las habilidades de datos necesarias para convertir grandes conjuntos de datos de secuenciación en hallazgos biológicos reproducibles y robustos. Con esta guía práctica, aprenderá a utilizar herramientas de código abierto disponibles gratuitamente para extraer significado de grandes y complejos conjuntos de datos biológicos.
En ningún otro momento de la historia de la humanidad, nuestra capacidad para comprender las complejidades de la vida ha dependido tanto de nuestras habilidades para trabajar y analizar datos. Este libro de nivel intermedio enseña las habilidades computacionales y de datos generales que necesita para analizar datos biológicos. Si tiene experiencia con un lenguaje de scripting como Python, está listo para comenzar.
- Pase de manejar pequeños problemas con scripts desordenados a abordar grandes problemas con métodos y herramientas inteligentes
- Procese datos de bioinformática con potentes pipelines y herramientas de datos de Unix
- Aprenda a utilizar técnicas de análisis de datos exploratorios en el lenguaje R
- Utilice métodos eficientes para trabajar con datos de rango genómico y operaciones de rango
- Trabaje con formatos de archivos de datos genómicos comunes como FASTA, FASTQ, SAM y BAM
- Gestione su proyecto de bioinformática con el sistema de control de versiones Git
- Aborde tareas tediosas de procesamiento de datos con scripts de Bash y Makefiles
Autor: Vince Buffalo
Editorial: O'Reilly Media
Publicado: 08/04/2015
Páginas: 538
Tipo de encuadernación: Tapa blanda
Peso: 1.90lbs
Tamaño: 9.20h x 7.00w x 1.20d
ISBN13: 9781449367374
ISBN10: 1449367372
Categorías BISAC:
- Informática | Programación | Código abierto
- Ciencia | Bioinformática
- Ciencia | Ciencias de la vida | Bioquímica
Sobre el autor
Vince Buffalo es actualmente un estudiante de posgrado de primer año que estudia genética de poblaciones en el laboratorio de Graham Coop en la UC Davis en el Grupo de Posgrado en Biología de Poblaciones. Antes de comenzar su doctorado en genética de poblaciones, Vince trabajó profesionalmente como bioinformático en el Bioinformatics Core del UC Davis Genome Center y en el Departamento de Ciencias Vegetales. Un programador obsesivo desde que era un adolescente, Vince se sintió atraído por los problemas estadísticos y computacionales de la genómica. Trabaja en herramientas de bioinformática de código abierto en su trabajo y tiempo libre, y disfruta de la pesca con mosca y la cocina cuando está lejos de la computadora.