Descripción
Descubra bibliotecas de secuenciación de próxima generación modernas del potente ecosistema de Python para realizar investigaciones de vanguardia y analizar grandes cantidades de datos biológicos
Características principales:
- Realice análisis bioinformáticos complejos utilizando las bibliotecas y aplicaciones Python más esenciales
- Implemente secuenciación de próxima generación, metagenómica, automatización de análisis, genética de poblaciones y mucho más
- Explore diversas técnicas estadísticas y de aprendizaje automático para el análisis de datos bioinformáticos
Descripción del libro:
La bioinformática es un campo de investigación activo que utiliza una variedad de cálculos simples a avanzados para extraer información valiosa de datos biológicos, y este libro le mostrará cómo gestionar estas tareas utilizando Python.
Esta tercera edición actualizada de Bioinformatics with Python Cookbook comienza con una descripción general rápida de las diversas herramientas y bibliotecas en el ecosistema de Python que lo ayudarán a convertir, analizar y visualizar conjuntos de datos biológicos. A continuación, cubrirá técnicas clave para la secuenciación de próxima generación, el análisis de células individuales, la genómica, la metagenómica, la genética de poblaciones, la filogenética y la proteómica con la ayuda de ejemplos del mundo real. Aprenderá a trabajar con sistemas de tuberías importantes, como los servidores Galaxy y Snakemake, y comprenderá los diversos módulos de Python para programación funcional y asincrónica. Este libro también lo ayudará a explorar temas como el descubrimiento de SNP utilizando enfoques estadísticos en marcos de computación de alto rendimiento, incluidos Dask y Spark. Además de esto, explorará la aplicación de algoritmos de aprendizaje automático en bioinformática.
Al final de este libro de Python para bioinformática, estará equipado con los conocimientos necesarios para implementar las últimas técnicas y marcos de programación, lo que le permitirá manejar datos bioinformáticos a todas las escalas.
Lo que aprenderá:
- Familiarizarse con bibliotecas de procesamiento de datos como NumPy, pandas, arrow y zarr en el contexto del análisis bioinformático
- Interactuar con bases de datos genómicas
- Resolver problemas del mundo real en los campos de la genética de poblaciones, la filogenética y la proteómica
- Construir pipelines bioinformáticos utilizando un servidor Galaxy y Snakemake
- Trabajar con functools e itertools para programación funcional
- Realizar procesamiento paralelo con Dask en datos biológicos
- Explorar técnicas de análisis de componentes principales (PCA) con scikit-learn
A quién va dirigido este libro:
Este libro está dirigido a analistas de bioinformática, científicos de datos, biólogos computacionales, investigadores y desarrolladores de Python que desean abordar problemas biológicos y bioinformáticos de intermedios a avanzados. Se espera un conocimiento práctico del lenguaje de programación Python. También será útil un conocimiento básico de biología.
Autor: Tiago Antao
Editorial: Packt Publishing
Publicado: 27/09/2022
Páginas: 360
Tipo de encuadernación: Tapa blanda
Peso: 1.36 lbs
Tamaño: 9.25h x 7.50w x 0.75d
ISBN13: 9781803236421
ISBN10: 1803236426
Categorías BISAC:
- Informática | Ciencia de datos | General
- Informática | Lenguajes | Python
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