Informática práctica para biólogos

Cada vez más, los científicos se enfrentan a conjuntos de datos y análisis exponencialmente más grandes sin las herramientas adecuadas para manejarlos. Muchos biólogos terminan usando programas de hojas de cálculo para la mayoría de sus tareas de procesamiento de datos y pasan horas haciendo clic o copiando y pegando, para luego repetir el proceso para otros archivos de datos.

Informática práctica para biólogos le muestra cómo usar muchas herramientas informáticas disponibles gratuitamente para trabajar de manera más potente y eficaz. El libro surgió de la propia experiencia de los autores en el desarrollo de herramientas para su investigación y en la ayuda a otros biólogos con sus problemas computacionales. Aunque muchas de las técnicas son relevantes para la bioinformática molecular, la motivación del libro es mucho más amplia, centrándose en temas y técnicas aplicables a una variedad de esfuerzos científicos. Veintidós capítulos organizados en seis partes abordan estos temas (y más; vea el Contenido):

*Búsqueda con expresiones regulares

*La línea de comandos de Unix

*Programación y depuración en Python

*Creación y edición de gráficos

*Bases de datos

*Realización de análisis en servidores remotos

*Trabajo con electrónica

Si bien la mayoría de los conceptos y ejemplos se aplican a cualquier sistema operativo, la narrativa principal se centra en Mac OS X. Cuando hay diferencias para los usuarios de Windows y Linux, se proporcionan instrucciones paralelas en el margen y en un apéndice. El libro está diseñado para ser utilizado como un recurso autodidacta para investigadores, un libro complementario en un curso o como un libro de texto principal. Informática práctica para biólogos lo liberará de los aspectos más frustrantes y que consumen más tiempo del procesamiento de datos para que pueda concentrarse en los placeres de la investigación científica.

RECURSOS

Para estudiantes

El sitio web complementario incluye descargas, foros comunitarios, consejos y ejemplos, y erratas y actualizaciones del libro de texto.

Para instructores

La Biblioteca de recursos para instructores incluye todas las figuras y tablas del libro de texto, proporcionadas en presentaciones de PowerPoint listas para usar.

Autor: Steven H. D. Haddock, Casey W. Dunn
Editorial: Sinauer Associates Is an Imprint of Oxford Un
Publicado: 05/11/2010
Páginas: 564
Tipo de encuadernación: Tapa blanda
Peso: 2.64 libras
Tamaño: 9.07h x 7.58w x 1.03d
ISBN13: 9780878933914
ISBN10: 0878933913
Categorías BISAC:
- Ciencia | Ciencias de la vida | Biología

Sobre el autor

Steven H.D. Haddock es científico investigador en el Monterey Bay Aquarium Research Institute y profesor asociado adjunto en la Universidad de California, Santa Cruz, donde estudia la bioluminiscencia y la biodiversidad del zooplancton gelatinoso. Comenzó a programar en BASIC en un Apple ][ y comenzó sus estudios universitarios en ingeniería antes de decidir cambiar de campo. Llevó esta experiencia en programación a sus estudios de posgrado en Biología Marina, donde rápidamente se dio cuenta de las ventajas que ofrecían las habilidades informáticas y se sintió obligado a ayudar a fomentar estas habilidades en otros. Ha desarrollado muchas utilidades y dispositivos para la investigación, incluidos instrumentos para monitorear la bioluminiscencia de las luciérnagas, un sistema de monitoreo de congeladores, una base de datos de registro de conferencias basada en la web y una calculadora de PCR para teléfonos inteligentes. Además de enseñar zoología de invertebrados y escribir un folleto para enseñar la técnica del buceo en aguas azules, ha impartido tutoriales de informática a estudiantes y
administradores. Su interés en la educación se extiende a su página web de bioluminiscencia (http: //lifesci.ucsb.edu/ biolum/) y al sitio web de ciencia ciudadana Jellywatch.org (www.jellywatch.org).

Casey W. Dunn, profesor de la Universidad de Yale, realiza investigaciones que tienen un gran componente computacional, pero siempre en conjunto con el trabajo de campo y de laboratorio. Su primer interés en las computadoras surgió de la construcción de productos electrónicos, y desarrolló aún más sus habilidades computacionales trabajando en Silicon Valley mientras era estudiante universitario. A medida que sus conjuntos de datos crecían cada vez más durante sus estudios de posgrado y su posdoctorado, se encontró recurriendo a sus antecedentes informáticos con más frecuencia. En el curso de su propia investigación y ayudando a otros biólogos con sus desafíos computacionales, se preocupó por la disparidad entre las oportunidades de capacitación y los problemas computacionales reales que enfrentan los biólogos día a día. Además de enseñar biología de invertebrados, evolución y desarrollo, sus actividades educativas incluyen los sitios web siphonophores.org y creaturecast.org. El Dr. Dunn es el ganador del Premio Alan T. Waterman 2011 de la National Science Foundation, que reconoce a un joven destacado
investigador en cualquier campo de la ciencia o la ingeniería apoyado por la NSF.