Python para biólogos: Un curso de programación completo para principiantes

Aprender a programar es una de las mejores inversiones que puedes hacer para tu investigación y tu carrera. Python para biólogos es un curso completo de programación para principiantes que te dará las habilidades que necesitas para abordar problemas comunes de biología y bioinformática.

¿Por qué aprender a programar?

Quizás ves a colegas escribiendo programas para ahorrar tiempo y manejar grandes conjuntos de datos.
Quizás tu supervisor te ha dicho que necesitas aprender a programar para tu próximo proyecto.
Quizás has estado mirando anuncios de trabajo y has notado cuántos de ellos solicitan habilidades de programación.

Tabla de contenido

• En el capítulo uno, aprenderás por qué Python es una buena opción tanto para biólogos como para principiantes. También aprenderás cómo instalar Python para tu sistema operativo y cómo configurar tu entorno de programación, con enlaces a todo el software gratuito que necesitarás.
• En el capítulo dos, aprenderás cómo manipular texto (incluidas las secuencias de ADN y proteínas) y cómo corregir errores en tus programas. Ejercicios: cálculo de contenido de AT, empalme de intrones.
• En el capítulo tres, aprenderás cómo leer y escribir datos desde y hacia archivos. También aprenderás cómo manejar rutas de archivos y el formato de archivo FASTA. Ejercicios: división de ADN genómico, escritura de un archivo FASTA.
• En el capítulo cuatro, aprenderás cómo procesar muchas piezas de datos en un solo programa y herramientas más avanzadas para la manipulación de secuencias. Ejercicios: recorte de secuencias adaptadoras, concatenación de exones.
• En el capítulo cinco, aprenderás cómo hacer que Python sea aún más útil creando tus propias funciones, incluyendo las mejores formas de probar esas funciones para acelerar el desarrollo. Ejercicios: Análisis de la composición de aminoácidos de secuencias proteicas.
• En el capítulo seis, aprenderás a escribir programas que puedan tomar decisiones inteligentes sobre cómo manejar los datos y cómo hacer que tus programas sigan reglas complejas. Ejercicios: filtrado de genes basado en múltiples criterios.
• En el capítulo siete, aprenderás una herramienta increíblemente poderosa para trabajar con patrones en texto (expresiones regulares) y cómo usarla para buscar en secuencias de ADN y proteínas. Ejercicios: filtrado de nombres de acceso y cálculo de tamaños de fragmentos de restricción.
• En el capítulo ocho, aprenderás cómo almacenar enormes cantidades de datos de una manera que aún permita recuperarlos de manera muy eficiente. Esto permite la simplificación de gran parte del código de capítulos anteriores. Ejercicios: traducción de secuencias de ADN a proteínas.
• En el capítulo nueve, aprenderás cómo hacer que tus programas Python funcionen en armonía con las herramientas existentes y cómo pulir tus programas para que estén listos para que otras personas los usen. Ejercicios: conteo de k-meros, clasificación de secuencias de ADN por longitud.

Sobre el autor

El Dr. Martin Jones ha estado enseñando a biólogos a escribir software durante más de cinco años y ha enseñado a todos, desde posgraduados hasta investigadores principales (PIs). Actualmente es profesor de Bioinformática en la Universidad de Edimburgo.

Autor: Martin Jones
Editorial: Createspace Independent Publishing Platform
Publicado: 07/09/2013
Páginas: 244
Tipo de encuadernación: Tapa blanda
Peso: 0.97lbs
Tamaño: 9.69h x 7.44w x 0.51d
ISBN13: 9781492346135
ISBN10: 1492346136
Categorías BISAC:
- Informática | Lenguajes de programación | Python

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