Descripción
Descubra más de 80 recetas para modelar y manejar datos biológicos de la vida real utilizando bibliotecas modernas del ecosistema R
Características clave:
- Aplique paquetes R modernos para procesar datos biológicos utilizando ejemplos del mundo real
- Represente datos biológicos con visualizaciones y flujos de trabajo avanzados adecuados para investigación y publicaciones
- Resuelva problemas de bioinformática del mundo real como transcriptómica, genómica y filogenética
- La compra del libro impreso o Kindle incluye un eBook en PDF gratuito
Descripción del libro:
La segunda edición actualizada de R Bioinformatics Cookbook adopta un enfoque basado en recetas para mostrarle cómo realizar investigaciones y análisis prácticos en biología computacional con R. Aprenderá cómo crear un entorno de trabajo R útil y modular, junto con la carga, limpieza y análisis de datos utilizando las herramientas más actualizadas de Bioconductor, ggplot2 y tidyverse.
Este libro lo guiará a través de las herramientas de Bioconductor necesarias para comprender y llevar a cabo protocolos en RNA-seq y ChIP-seq, filogenética, genómica, búsqueda de genes, anotación de genes, análisis estadístico y análisis de secuencias. A medida que avance, descubrirá cómo usar Quarto para crear informes, presentaciones y sitios web ricos en datos, además de obtener una comprensión clara de cómo se pueden aplicar las técnicas de aprendizaje automático en el dominio de la bioinformática. Los capítulos finales lo ayudarán a desarrollar dominio en habilidades clave, como el análisis de anotación de genes y la programación funcional en purrr y R base. Finalmente, descubrirá cómo usar las últimas herramientas de IA, incluido ChatGPT, para generar, editar y comprender el código R y los borradores de flujos de trabajo para análisis complejos.
Al final de este libro, habrá adquirido una sólida comprensión de las habilidades y técnicas necesarias para convertirse en un especialista en bioinformática y trabajar eficientemente con conjuntos de datos bioinformáticos grandes y complejos.
Lo que aprenderá:
- Configurar un entorno de trabajo para el análisis bioinformático con R
- Importar, limpiar y organizar datos bioinformáticos usando tidyr
- Crear gráficos, informes y presentaciones con calidad de publicación usando ggplot2 y Quarto
- Analizar RNA-seq, ChIP-seq, genómica y genética de próxima generación con Bioconductor
- Buscar genes y proteínas realizando filogenética y anotación de genes
- Aplicar técnicas de ML a datos bioinformáticos usando mlr3
- Agilizar el trabajo programático utilizando iteradores y herramientas funcionales en los paquetes base R y purrr
- Usar ChatGPT para crear, anotar y depurar código y flujos de trabajo
Para quién es este libro:
Este libro es para bioinformáticos, analistas de datos, investigadores y desarrolladores de R que desean abordar problemas biológicos y bioinformáticos de nivel intermedio a avanzado aprendiendo a través de un enfoque basado en recetas. Se requiere conocimiento práctico del lenguaje de programación R y conocimientos básicos de bioinformática.
Autor: Dan MacLean
Editorial: Packt Publishing
Publicado: 31/10/2023
Páginas: 396
Tipo de encuadernación: Tapa blanda
Peso: 1.49 lbs
Tamaño: 9.25h x 7.50w x 0.81d
ISBN13: 9781837634279
ISBN10: 1837634270
Categorías BISAC:
- Computadoras | Ciencia de datos | Visualización de datos
- Tecnología e Ingeniería | Biomédica
Este título no es retornable